Microsoft Research a dévoilé BioEmu 1, un système d’IA révolutionnaire qui redéfinit la recherche en génomique grâce à une analyse du repliement des protéines considérablement accélérée.
Ce modèle d’apprentissage profond peut générer des milliers de structures protéiques statistiquement indépendantes par heure sur un seul GPU, fonctionnant à des vitesses dix fois supérieures à AlphaFold 2, qui était auparavant considéré comme la référence dans le domaine. Alors qu’AlphaFold a bouleversé la prédiction de la structure statique des protéines, BioEmu 1 va plus loin en modélisant le comportement dynamique des protéines—capturant toute la gamme des conformations que les protéines adoptent naturellement.
BioEmu 1 atteint cette performance remarquable en intégrant trois sources de données essentielles : les structures de la base de données AlphaFold, un vaste ensemble de données de simulations de dynamique moléculaire et des données expérimentales sur la stabilité du repliement des protéines. L’efficacité du système est telle que les laboratoires universitaires peuvent désormais effectuer des balayages virtuels complexes de mutagenèse pendant de courtes pauses, des tâches qui nécessitaient auparavant des jours ou des semaines de calcul.
« La dynamique des protéines s’impose comme la prochaine étape de la découverte après la prédiction précise de la structure », souligne le professeur Martin Steinegger de l’Université nationale de Séoul. « Grâce à BioEmu, les scientifiques peuvent maintenant accéder rapidement à des opérations d’échantillonnage du paysage d’énergie libre des protéines grâce à la technologie d’apprentissage profond. »
L’impact de cette technologie va au-delà de la recherche académique. Dans le domaine de la découverte de médicaments, BioEmu 1 peut identifier des poches de liaison cryptiques souvent difficiles à détecter avec les méthodes conventionnelles, offrant ainsi de nouvelles cibles pour l’intervention thérapeutique. Le système prédit également avec précision la stabilité des protéines grâce à des calculs d’énergie libre de repliement qui correspondent aux résultats des évaluations expérimentales.
Microsoft a publié BioEmu 1 en tant que logiciel libre, contrairement à certains concurrents qui adoptent des approches plus restrictives. Cette décision permet aux chercheurs du monde entier de faire progresser leurs études sur la dynamique des protéines, ce qui pourrait accélérer les découvertes biomédicales, y compris l’avancement de la conception de médicaments. En juillet 2025, l’adoption précoce suggère que la technologie pourrait réduire les coûts de développement de médicaments jusqu’à 30 %, selon des analystes du secteur.